3D Slicer 图像分割标注教程
在3DSlicer(4.10.1)中进行三维体数据的图像分割标注。扩展教程：3DSlicer-医学图像检测标注教程(矩形框)3DSlicer-医学图像检测标注教程(导入查看标签与修改标签)
1.读取数据三维体数据一般为DICOM格式或者NIFIT格式，DICOM：将包含.dcm文件序列的文件夹拖入3DSlicer，或者点击左上角的dcm图标：在DICOMBrowserImport，导入.dcm序列后，examimeandload：NIFIT：直接将.nii文件拖入3DSlicer即可。
2.勾画标签1.选择Segmentations模块，点击"CreatenewSegmentation"：Create之后可以通过Rename修改名字。2.添加Segment：点击Editselected之后，会到SegmentEditor模块。3.编辑Segment:双击Segment的Color可修改颜色，双击Name可修改名字。通过Effects下的不同工具可在体数据的三个视图上勾画label：点击Showdetails查看各个工具的使用方法。点击show3D可显示segment三维图。
3.保存标签勾画label完成后，切换到Data模块，可以看到刚刚所勾画的label：
注意，有多个Segment的时候，若只想保存其中一个，则需要将其他的Segment设为不可见，即关闭Segment右侧的小眼睛。每次保存的是同级目录下的所有设为可视的Segment。
选中想要保存的segment，右键，选择"Exportvisiblesegmentstobinarylabelmap"，再选中出现的labelmap:右键，选择"ExporttoDIOCM…"，选择路径进行保存。保存为DICOM格式后，也可以重新打开，然后将其保存为NIFIT格式。
3.显示多个标签将原始体数据和多个label的.nii同时打开，然后在Segment模块中，首先新建一个Segmentation，然后为每一个label添加一个Segment，具体方法为：
选中一个Segment；选择labeld对应的Volume；点击Threshold工具；设置高低阈值为label的值（可将鼠标在右侧可视化图中移动，左下角会显示当前鼠标位置的灰度值）；点击apply。为每个label都添加Segment并apply之后，可以在右侧看到不同label的可视化图：将MasterVolume切换为原始体数据：就可以看到label在原始体数据上的叠加效果：